Principales dynamiques englobant la médecine de précision

La dynamique principale à l’origine de la création de la nouvelle classification des maladies parodontales a englobé les résultats du projet microbiote humain et le concept de médecine de précision. En 2007, les National Institutes of Health (NIH) des États-Unis ont lancé un vaste projet qui s’est transformé en une initiative internationale toujours en cours « The Human Microbiome Project ».¹³ Ces efforts aident les scientifiques et les cliniciens à mieux comprendre comment le microbiome humain et ses interactions avec le système immunitaire humain protègent leur hôte ou lui nuisent. Ces informations présentent une vue plus réaliste des différents microbiomes présents dans le corps humain et aident les cliniciens à comprendre comment concentrer au mieux leurs efforts lors du traitement de leurs patients.

Les résultats de ce projet ont révélé à quel point notre microbiome est important pour notre existence en tant qu’humains et que les microbes sont dix fois plus nombreux que les cellules humaines! Le microbiome humain est composé d’une partie « centrale » et d’une partie « variable ».¹⁴ Le noyau est partagé entre tous les humains, tandis que le microbiome variable est exclusif à chaque individu en fonction de son phénotype, de son génotype et de son mode de vie unique.¹⁴ Les différences d’espèces et de souches de cette partie variable du microbiome entre les individus peuvent être aussi uniques que leur empreinte digitale! Cela est également vrai pour le microbiome buccal.

Les microbes ne sont généralement pas présents dans la nature sous la forme d’une culture pure d’une seule espèce, mais existent dans une communauté de microbes, que l’on appelle collectivement un microbiome. Chez l’hôte humain, le microbiome existe dans plusieurs niches anatomiques, chacune ayant ses propres microbiome et métagénome exclusifs, c’est-à-dire les cheveux, la peau, le tractus gastro-intestinal, le tractus urogénital, le vagin, les sinus nasaux et paranasaux, et la cavité buccale. Dans des conditions idéales, ces niches microbiennes représentent une communauté équilibrée entre les espèces, ce qui est important pour le maintien de la santé humaine. Chaque habitant microbien de la communauté maintient un écosystème unique qui est orienté vers des interactions symbiotiques entre les différents microbes de cet écosystème particulier, y compris l’hôte. Cependant, lorsque les conditions ne sont pas idéales et que leur niche devient déséquilibrée, on dit que ces communautés sont dans un état de dysbiose menant à la maladie.

Si nous traduisons cette information dans la cavité buccale, cet état de dysbiose explique comment les maladies buccales se produisent, notamment le déplacement microbien de la gingivite vers la parodontite. La cavité buccale abrite le deuxième plus grand nombre de microbiotes après l’appareil digestif. Ainsi, le projet a maintenant permis de développer des bases de données microbiennes spécifiques aux organes : le Human Intestinal Tract et l’expanded Human Oral Microbiome Database (eHomd). À ce jour, près de 800 espèces orales spécifiques ont été ajoutées à la base de données sur les microbiomes buccaux, mais on pense qu’il en existe bien plus de 1 000.

Cette compréhension a créé un changement de paradigme majeur dans l’identification de l’étiologie primaire des maladies parodontales. Ce que l’on considère aujourd’hui comme des connaissances anciennes est que des agents pathogènes parodontaux virulents spécifiques provoquent la dégradation des tissus parodontaux (principalement des bactéries anaérobies Gram-négatives). Le problème avec cette théorie est qu’aucune bactérie spécifique n’a jamais été démontrée comme étant la seule cause de la maladie parodontale. Ainsi, la nouvelle théorie dominante est que la gravité de la maladie varie en fonction de l’environnement du microbe-hôte. La dégradation parodontale chez les individus sensibles crée un environnement propice à des microbes particuliers, qui prolifèrent ensuite. Certains microorganismes ou groupes de microorganismes peuvent être considérés comme des organismes relais et peuvent faciliter le transfert de la symbiose à la dysbiose chez un hôte sensible. Certains microbes peuvent se trouver en bonne santé par voie intraorale et maintenir cet état sain, cependant une interférence avec cet état symbiotique conduit à une dysbiose entraînant une maladie parodontale.

Avec ce changement majeur dans la compréhension des causes sous-jacentes des maladies, une nouvelle approche pour le traitement et la prévention des maladies, qui prend en compte la variabilité individuelle des gènes, de l’environnement et du mode de vie de chaque personne, a été créée sous le nom de « médecine de précision », auparavant appelée médecine personnalisée. La médecine de précision repose essentiellement sur l’identification des approches thérapeutiques les plus efficaces pour chaque patient en fonction des facteurs génétiques et environnementaux et du mode de vie. Cela contraste avec l’approche « universelle » qui a dominé la médecine et la dentisterie traditionnelles pendant des décennies

La commercialisation du microbiome humain en tant que thérapie médicamenteuse a déjà commencé. En 2013, des patients infectés par C. dificile ont été traités avec succès par infusion duodénale du microbiote fécal d’un individu sain!⁹ La possibilité d’utiliser les informations génétiques et autres informations moléculaires des patients dans le cadre des soins médicaux de routine et peut-être dentaires pourrait bientôt devenir une réalité. Grâce à ces nouvelles découvertes en métagénomique et en microbiomique, il sera plus facile de prévoir quels traitements seront les plus efficaces pour des patients précis. En outre, on comprendra mieux les mécanismes sous-jacents à l’apparition de diverses maladies, ce qui permettra d’améliorer les méthodes de prévention, de diagnostic et de traitement d’un large éventail de maladies.

Parce que chaque individu abrite un microbiome unique qui joue un rôle clé dans l’étiologie de la maladie dans l’organisme, la maladie peut se manifester et progresser différemment selon les individus et cela rend la médecine de précision impérative pour des soins de santé optimaux. Grâce à ces nouvelles connaissances, la nouvelle classification des maladies parodontales est devenue plus axée sur la biologie, englobant le concept de médecine de précision, qui comprend à la fois la dysbiose microbienne et la réponse hyperinflammatoire de l’hôte.

Avec ce modèle en tête, l’idée de créer des définitions de cas de patients plus individualisées s’est concrétisée. En utilisant le modèle médical de classification des stades et de gradation, les auteurs de la nouvelle classification ont pu combiner certains des facteurs généralement utilisés dans la détermination des maladies, tels que la gravité, l’étendue, la vitesse de progression, les facteurs de risque, etc. pour créer une méthode permettant de définir plus précisément les cas individuels. Ce système sera examiné plus en détail au point 5(b) Parodontite.